NIPT: prenatala sållningsundersökningar

NIPT-undersökningen kräver ett blodprov av den gravida kvinnan. Innan detta blodprov tas informeras hon ingående och tydligt om testet och vad testresultatet kunde innebära. Endast yrkesutbildade personer inom hälso- och sjukvård kan beställa provtagning för NIPT och NIPT-undersökning. För undersökningen fylls i första hand i en elektronisk remiss, men i brist på elektroniska kommunikationsmedel används pappersremiss. För undersökningen tas ett venöst blodprov av den gravida kvinnan i ett Streckprovrör som skickas till ÅUCS Genomiklaboratorium (Tyks Genomiikan Laboratorio) för analys. Om remissen gäller den omfattande sållningsundersökningen B-NIPTdel (se Testalternativen nedan), ska en samtyckesblankett också ifyllas i och skickas tillsammans med provet till laboratoriet (se avsnittet Samtyckesblankett för omfattande undersökning).

• Remiss och patientanvisning
• Laboratorieinstruktionsbok

I laboratoriet analyseras cellfritt DNA från fostret (cell free fetal DNA, cffDNA) som härstammar från moderkakan. Från och med graviditetsvecka 10 kan en tillräcklig mängd av cellfritt DNA från fostret för NIPT-test detekteras i den gravida kvinnans blodomlopp.

Testresultatet tolkas av en yrkesutbildad person inom hälso- och sjukvården. Resultatet är vanligtvis klart inom 7–10 arbetsdagar, men svarstiden kan förlängas av tekniska skäl. Ibland finns det alltför lite DNA-material i blodprovet för NIPT-testet. I detta fall informerar laboratoriet barnmorskan eller läkaren som beställt testet att göra en ny remiss för blodprovtagning.

I undersökningen används Veriseq v2-metoden från Illumina Inc (illumina.com). Metoden bygger på låg täckning av sekvensering av hela genomet och resultaten analyseras med en bioinformatikprogramvara utvecklad för ändamålet (Individual Fetal Aneuploidy Confidence Test, iFACT). Metoden är godkänd enligt IVDR-regelverket. Metoden kan användas för identifiering av ändringar i antalet kromosomer för alla kromosomer och för identifiering av kopior av kromosomsegment som är större än 7 Mb (se Testalternativen nedan). Analysen av kromosomsegmentkopior gäller inte specifika kliniska syndrom, utan avvikande kromosomsegmentkopior kan upptäckas var som helst i genomet, förutsatt att dess storlek är över 7 Mb. Därför kan inte metoden användas för att identifiera kända kopior av mindre storlek, bl.a. deletioner i 22q11-området som är associerade med DiGeorges syndrom. Om den remitterande parten planerar undersökning av kromosomsegmentkopior, rekommenderas kontakt med ÅUCS Genomiklaboratorium för verifiering av att testet lämpar sig för det tilltänka ändamålet.

Metodens känslighet och precision

Känslighet och precision rapporterade av tillverkaren: För kromosomerna 13, 18 och 21 är känsligheten >99,9% och precisionen >99,9%. För sällsynta autosomala aneuploidier är känsligheten 96,4% och precisionen 99,8%. För kopieringsavvikelser över 7 Mb är känsligheten 74,1% (valideringsdatat innehåller mosaikiska prover) och precisionen 99,4%. För könskromosomerna är konkordansen 100% (XX, XY, XXX, XXY). För X0- och XYY-förändringar är konkordansen 90,5% respektive 91,7% (Pertile et al. 2021, Clin Chem).

Vid beställning av den omfattande B-NIPTdel-undersökningen är det viktigt att med den gravida kvinnan diskutera möjligheten av och betydelsen av slumpmässiga fynd innan samtycket undertecknas. Undersökningen kräver alltid den gravida kvinnans samtycke. Genom att underteckna samtycket godkänner hon undersökningen och rapportering av eventuella slumpmässiga fynd.

Samtycksblankett:

Fördelar

Blodprovet för undersökningen tas från den gravida kvinnan. Därigenom undviks den lilla risken för missfall som är förknippad med invasiva procedurer (placentaprover och fostervattensprover). NIPT-undersökningen kan utföras redan från och med graviditetsvecka 10. Den kan utföras också vid tvillinggraviditeter och graviditeter med donerade könsceller.

Begränsningar

NIPT-undersökningen är en sållningsundersökning och resultatet utgör en kalkylerad risk för kromosomavvikelser hos fostret. Också fostrets kön är en kalkylerad prognos. Sållningsundersökning eller screeningundersökning innebär att trots att testet är mycket tillförlitligt, finns det en liten risk för falskt positivt eller falskt negativt resultat. Eftersom NIPT-undersökningen inte är någon diagnostisk undersökning, måste ett avvikande resultat alltid bekräftas genom fostervattensundersökning. Ett normalt resultat utesluter inte möjligheten att fostret har en kromosomavvikelse eller annan genetisk avvikelse (t.ex. en genmutation) som inte kan upptäckas med NIPT metoden. Dessutom kan bl.a. betydande övervikt hos den gravida kvinnan, vissa läkemedel och organtransplantation påverka resultatets tillförlitlighet. NIPT-undersökningen rekommenderas inte om graviditeten inledningsvis var en tvillinggraviditet och det ena av fostren avlidit under graviditetens lopp.

Metodens sensitivitet vad gäller könsbestämning är cirka 99,9%, vilket innebär att i en liten andel av NIPT-undersökningsresultaten stämmer det enligt metoden förväntade könet inte överens med fostrets faktiska kön, eftersom fostrets kön bestäms utifrån en kalkylmässig prognos. För könskromosomala förändringar kan studien upptäcka X0-, XXX-, XXY- och XYY-avvikelser. När det gäller tvillingars kön analyseras Y-kromosomen. Om någon Y-kromosom inte identifieras, är båda fostren flickor. Om Y-kromosomen däremot påvisas, förutsäger undersökningen att antingen ett av fostren eller bäggedera är pojkar.

I fall av tvillinggraviditet går det inte på basis av ett avvikande NIPT-resultat att fastställa vilketdera av fostren har kromosomförändringen.  Fostervattenprover behövs för att fastställa detta.

I det omfattande NIPTdel-testet kan i sällsynta fall ett avvikande fynd härstamma från den gravida kvinnan och inte från fostret. Detta kan bero t.ex. på en medfödd kromosomförändring hos den gravida kvinnan eller på en malign tumör. Om ett sådant bifynd upptäcks, ska kvinnan remitteras för lämplig rådgivning gällande behov av närmare utredningar.

Sållningsundersökning (B-NIPTseu 13808) beställs i samband med ultraljudsundersökningen. Inom ramen för denna undersökning utreds bara antalet kromosomer 13, 18 och 21 hos fostret. Könskromosomerna undersöks inte. Tillsammans med ultraljudsundersökningen ersätter NIPT-sållningen den tidigare använda sållningen under första graviditetstrimestern (S-Tr1Seul, 4548).

Remiss (Åland):

Grundundersökningen (B-NIPTtri 6373) sållar för de vanligaste kromosomförändringarna hos fostret, dvs. förändringar i antalet kromosomerna 13, 18, 21, X och Y. Om så önskas, innehåller svaret också information om fostrets förväntade kön. Om en förändring i antalet könskromosomer konstateras, dvs. om resultatet inte är XX eller XY, innehåller svaret information om detta, oberoende av om man önskat information om fostrets kön eller inte.

Den omfattande undersökningen (B-NIPTdel 6374) sållar kromosomvis för avvikande kromosomantal (alltför många eller alltför få) och för större (över 7 megabaspar) förändringar i antalet baskopior med tänkbar klinisk betydelse. Sådana förändringar (duplikationer och deletioner) kan påverka fostrets tillväxt, visa sig som strukturella avvikelser eller påverka moderkakans funktion. Ibland begränsas förändringarna som upptäcks i den omfattande NIPT-undersökningen bara till moderkakan eller så förekommer de i så kallad mosaikform. Om så önskas, innehåller svaret också information om fostrets förväntade kön. Om en förändring i antalet könskromosomer konstateras (dvs. om resultatet inte är XX eller XY), innehåller svaret information om detta, oberoende av om man önskat information om fostrets kön eller inte.